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根据《北京大学博士研究生校长奖学金管理办法》，经过前沿交叉学院和生命科学学院组织的答辩和评审工作，本实验室2017级博士研究生张小雪同学和2019级博士研究生徐艺源同学获得了2021-2022年度校长奖学金。向两位同学表示热烈祝贺！

张小雪同学和徐艺源同学在课程学习、学术研究等方面均有优异表现，相信在今后的学习和科研中，将更好的发挥示范带动作用，鼓励本实验室的同学们更加专注学业精进，实现品学兼优、全面发展。

2021年6月21日，魏文胜课题组在Nature Biotechnology杂志在线发表了题为 “Genome-wide interrogation of gene functions through base editor screens empowered by barcoded sgRNAs”的研究论文。

基于CRISPR-Cas的功能性筛选技术为基因功能研究和药物靶点发现提供了有力手段。经典的CRISPR敲除筛选方法依赖于Cas9介导的双链DNA断裂。然而，DNA双链断裂的产生如果修复不及时会造成严重的细胞损伤。因此，Cas9靶向基因组多拷贝位点时极易引起细胞死亡，从而影响基因功能筛选的准确性。此外，在对基因组损伤更为敏感的原代细胞中，基因编辑产生的DNA切割会激活p53信号通路，从而引起细胞周期停滞乃至细胞死亡，使得在细胞中进行大规模筛选比较困难。比如在有野生型p53表达的人视网膜色素上皮细胞中，经典CRISPR基因敲除筛选呈现出信噪比过低的结果；在人多能干细胞中，对单个基因组位点的编辑也同样容易造成细胞死亡。近期有多篇报道针对如何在原代细胞中实现大规模基因组功能性筛选的技术方案展开了争论和探讨，但始终没有令人满意的解决方案。

针对上述问题，魏文胜课题组发展了名为iBARed cytosine Base Editing-mediated gene KnockOut （BARBEKO）的新型筛选方案。该方法利用胞嘧啶单碱基编辑器，通过靶向破坏蛋白质编码基因的起始密码子位点或剪接位点、或通过引入提前终止密码子的方式来实现非依赖DNA双链断裂的高效基因敲除。通过结合实验室之前建立的内置分子条形码（iBAR）设计sgRNA （Zhu et al. Genome Biology 2019），BARBEKO方案可以依赖高病毒感染复数建库，在提升筛选效率的同时极大减少了所需细胞数量。相较于经典的CRISPR基因敲除筛选，BARBEKO方法能将筛选所需细胞量降低10-100倍，并能够通用于正向和负向选择筛选，可以大幅提升全基因组水平功能性筛选的可行性与经济性。

方法成功在多种癌细胞系和表达野生型p53的正常细胞中实现了准确、高效的细胞适应性（fitness）筛选。该方法能有效避免基因拷贝数效应，有效降低负向筛选中与细胞死活相关的高假阳性率；在对DNA双链断裂敏感的细胞系中，该方法在筛选精度和准确率方面优势尤为明显（图1）。这些结果表明，BARBEKO方法为原代细胞、类器官或模式动物体内等复杂生物模型的高通量筛选提供了更优的选择；为数量受限的细胞样品（如病人来源的细胞）提供了高效筛选方案，因此是基因功能和临床前研究的有力工具。

图1 | BARBEKO筛选策略有效提升基因敲除筛选效率和准确性

北京大学魏文胜课题组博士生许萍、刘志恒博士、刘莹博士和博士生马华峥为该论文共同第一作者。该研究项目得到了国家自然科学基金重点项目、北京市科委生命科学前沿创新培育项目、北京未来基因诊断高精尖创新中心和北大-清华生命科学联合中心的基金支持。

文章链接：https://doi.org/10.1038/s41587-021-00944-1.

自2019年末新冠肺炎疫情爆发以来，课题组已经有一年半的时间没有集体出游了。在这个盛夏的毕业季，实验室精心组织了一场香山行，为忙于科研的大家放松减压，也为实验室的毕业生送上毕业祝福。

5月29日早8点30分，大家在香山公园东门准时集合，从山脚下的勤政殿出发，开始了这次的登山之行。前半段的山路较为平缓，大家有说有笑地缓步前进，也在“双清别墅”接受了爱国主义教育；后半段的山路渐渐陡峭，但是仍然没有阻挡大家向顶峰迈进的热情，虽然在夏日的骄阳下晒得有些汗流浃背，但是在半山腰稍作休息之后，大家继续迈开脚步，拾级而上，终于在10:30到达了香山的顶峰——香炉峰。

香山位于北京城西，这一天也是天朗气清，惠风和畅，站在山顶望去，整个北京城区尽收眼底。正所谓“凭高眺远，见长空，万里云无留迹”。大家在香炉峰合影留念，记录下这属于欢声笑语的美好时刻。

在我们每个人的人生路上都有一座又一座的山峰，它可以是眼前的课题实验，也可能是生活中的各种挑战。但是，我们每个人都要有“世上无难事，只要肯登攀”的精神，努力向前迈进，直到登上顶峰。在科研的大路上，我们Wei Lab也是一次又一次攀登科研高峰，并取得了不俗的成绩。祝福Wei Lab与Wei Lab的每位成员，都能在科研和人生上勇攀高峰，不断登顶！

                                                                                                                                    供稿人：牛煦然                   

经过生命科学学院组织的答辩和评审工作，本实验室2016级博士研究生张心怡同学获得了2019-2020学年度国家奖学金。向张心怡同学表示热烈地祝贺！

张心怡同学在课程学习、学术研究等方面均有突出表现，相信在今后的学习和科研中，将更好地发挥示范带动作用，鼓励本实验室的同学们更加专注学业精进，实现品学兼优、全面发展。

根据学校《关于2019-2020学年北京大学学生奖励评选工作的通知》、《关于2019-2020学年奖学金评审工作安排的通知》，经过个人申请、班级民主素质测评、导师推荐、学院审核等程序，本实验室岳頔同学获得2019-2020学年三好学生和研究生专项奖学金，王春慧和张心怡同学获得单项奖学金，伊宗裔同学获得学习优秀奖。

向几位同学表示热烈祝贺！

祝贺本课题组曹中正、陈一欧、刘志恒和璩良四位同学顺利通过学位答辩，取得博士学位！

希望各位同学今后张开翱翔的翅膀，追逐理想；荡起快乐的双桨，迎接希望。带着理想，举起希望，携着坚强，勇敢前往通向成功的大道上！愿心如所想！

经过生命科学学院组织的答辩和评审工作，本实验室2016级博士研究生张心怡同学获得了2020-2021年度校长奖学金。

北京大学“校长奖学金”是学校设立的资助额度最大、影响范围最广，同时也是师生最关切、竞争最激烈的学术荣誉称号。申请者除了德智体美劳全面发展以外，还需要满足以下三个条件：第一，攻读博士研究生期间发表过较高水平的学术论文或论著等；第二，参加过国家重大课题研究并取得阶段性成果；第三，上一学年度专业成绩排名在前5%。获奖同学在课程学习、学术研究等方面均有突出表现，相信在今后的学习和科研中，将更好的发挥示范带动作用，鼓励本实验室的同学们更加专注学业精进，实现品学兼优、全面发展。

2020年5月4日，本课题组与中国医学科学院病原生物学研究所，中科院北京基因组所在Cell Host & Microbe 杂志合作发表题为“Heightened innate immune responses in the respiratory tract of COVID-19 patients”的研究论文（当期封面文章）。

由SARS-CoV-2感染引起的2019年新型冠状病毒疾病（COVID-19）爆发对全球公共卫生构成了严重威胁。感染患者经常具有强烈的炎症反应，这种免疫失调，称为“细胞因子风暴”。 为了深入研究COVID-19患者的免疫特征，研究人员采集了肺泡灌洗液标本（BALF），其中8个样品来自COVID-19患者，146个样品来自社区性肺炎（CAP），20个样品来自健康人群（对照组）。通过宏转录组测序对BALF中的宿主转录组和病原体进行测序发现，SARS-COV-2样本中的差异表达基因数量明显高于病毒样CAP样本和非病毒样CAP样本，这表明SARS-CoV-2感染强烈干扰肺细胞的转录组稳态。

深入分析表明，COVID-19患者的呼吸道细胞中表现出了以趋化因子CXCL8、CCL2、CCL7等为主导的高细胞因子症状，提示患者肺部中的中性粒细胞和单核细胞的大量浸润。动态观察结果显示，随着时间推移，细胞因子表达水平逐渐降低，表明了COVID-19中的过度的炎症可以逐步得到解决，而持续发生的炎症可能产生不良后果。另外，与被认为诱导干扰素（IFN）反应不足的SARS-CoV相比，SARS-CoV-2强烈触发了许多IFN诱导型基因（ISG）的表达。与其它病毒如Dengue病毒、HCV的感染引起的ISG不同，SARS-CoV-2感染诱导的众多ISG除了具有抗病毒效应，还可能具有显著促炎反应的特征。这个结果提示，干扰素治疗需要在适当的时机进行，如果COVID-19患者已经产生了高细胞因子症状，干扰素治疗可能会加重免疫病理反应。该项研究揭示了COVID-19患者呼吸道的天然免疫特征，为深入理解SARS-CoV-2的致病机制和临床用药提供了依据。

本课题组周卓副研究员、中国医学科学院病原生物学研究所任丽丽研究员、中科院北京基因组所张莉博士、钟嘉鑫、以及中国医学科学院病原生物学研究所肖艳为本文的共同第一作者。中国医学科学院病原生物学研究所王健伟教授和中科院北京基因组所李明锟研究员为本文的共同通讯作者。该研究项目得到了传染病防治国家科技重大专项、中国医学科学院创新工程、国家自然科学基金、国家重点研发计划、中国科学院战略性先导科技专项、北京未来基因诊断高精尖创新中心等基金支持。

6月10日全国博士后管委会办公室和中国博士后科学基金会公示了2020年度“博士后创新人才支持计划”拟资助人选名单，本课题组博士生璩良入选。

博士后创新人才支持计划是人力资源和社会保障部、全国博士后管委会新设立的一项青年拔尖人才支持计划，旨在加速培养造就一批进入世界科技前沿的优秀青年科技创新人才，是我国培养高层次创新型青年拔尖人才的又一重要举措。2020年博士后创新人才拟资助人选共有400人，人选主要来自全国各大高校、中国科学院、军队系统等博士后设站单位。

博士后创新人才计划的待遇优厚，遴选严格。资助每人每年30万元，两年60万元，其中40万元为博士后日常经费，20万元为博士后科学基金。本次计划共有63个学科获资助，多数为基础学科，相比2019年增加3个学科。其中生物学入选人数最多，共有34人，比去年增加2人。其次是材料科学与工程，入选人数30人，化学共有28人入选。临床医学、物理学也都有20人以上入选，其余学科入选人数都在20人以下。

2020年度吴瑞奖获奖名单揭晓，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京大学生命科学学院魏文胜课题组博士生璩良获得殊荣。

被誉为华人生命科学领域在读博士最高奖项的吴瑞奖，由吴瑞纪念基金会（RWMF）于2008年设立，并于2009年首次颁发。吴瑞奖学金旨在鼓励生命科学领域的博士研究生努力将自己塑造成为未来生命科学领域的学术带头人，同时也纪念吴瑞教授在培养中国新一代生命科学研究领域杰出人才所做出的杰出贡献。在中国大陆、香港、澳门、台湾及新加坡的大学或研究所攻读博士学位的在读学生均可提出申请。吴瑞奖学金奖励从事生命科学领域的、有创新性、独立思考能力和专注奉献精神的博士研究生，该奖项每年颁发约十人次。

璩良于2015年在苏州大学医学部获学士学位，同年加入北京大学魏文胜课题组攻读博士学位（PTN项目），博士期间主要致力于新型基因编辑技术的开发及基因治疗应用研究。2019年，璩良与课题组其它成员合作开发了一种全新的RNA单碱基编辑技术—LEAPER（Leveraging Endogenous ADAR for Programmable Editing of RNA），该项研究摆脱了CRISPR/Cas系统中对外源蛋白的依赖，利用细胞内源编辑机制实现了精准的基因编辑，具有高精准、无免疫原性、容易递送、安全长效等诸多优势。研究成果以Article形式发表在Nature Biotechnology杂志。

2019年12月16日，本课题组在Genome Biology杂志在线发表题为“PASTMUS: mapping functional elements at single amino acid resolution in human cells”的研究论文。

精准绘制蛋白质功能图谱对于研究蛋白质的作用机制十分重要。传统方法通常需要构建蛋白质的截短突变，工作量巨大且效率低下。近年来一些高通量手段比如利用错义突变进行文库筛选、利用CRISPR-Cas系统产生覆瓦式（tiling）突变并结合sgRNA富集分析等被用于相关研究，但这些方法受限于覆盖程度及位点精度，而且均不适用于隐性遗传突变类型。

本课题组开发了名为PASTMUS（PArsing fragmented DNA Sequences from CRISPR Tiling MUtagenesis Screening）的新方法（图1）。通过CRISPR-Cas介导的覆瓦式突变首先对目标基因产生覆盖度高、种类丰富的突变体文库，结合功能性筛选和对目标基因碎片化后深度测序，再利用全新的生物信息学分析方法对数据进行多重过滤，最终实现了对蛋白质功能相关位点的精确定位。该论文分别对三种毒素受体蛋白和三种抗癌药物靶标蛋白进行了功能性扫描，实现了单氨基酸精度的蛋白功能图谱绘制。除此以外，PASTMUS方法还可以广泛应用于非编码RNA、启动子、增强子等调控性元件的研究，也可以演变为蛋白进化的高效手段。

本课题组博士生张心怡、岳頔、博士后刘莹以及已经毕业的王轶楠博士、周悦欣博士为该论文共同第一作者。该研究项目得到了国家自然科学基金重点、面上及青年项目、北京市科委生命科学前沿创新培育项目、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心以及传染病防治国家科技重大专项的基金支持。

文章链接:https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1897-7

今年是《麻省理工科技评论》创刊120周年，第三届“35岁以下科技创新35人”中国榜单在2019年12月14日的EmTech China全球新兴科技峰会揭晓。本实验室的博士后朱诗优同学荣获“先锋者”荣誉，获奖理由是他建立和优化基因组高通量功能性筛选方法学，实现安全高效的 RNA 单碱基编辑。

从1999年开始，每一年《麻省理工科技评论》都会选出一批35岁以下最具有创新性与影响力的科学家、科研工作者、科技创业者。在历年的获奖榜单上，有许多在具有产业化潜能的领域方面坚持科研使命的获奖人，也有海外顶尖学术机构的科学家们，这其中有超过半数以上的获奖者，都取得了世界级的突破性研究成果与发现。

朱诗优博士在本实验室的研究课题聚焦于基于 CRISPR-Cas9 系统的基因敲除的高通量功能性筛选方法学的建立和优化，首次建立了在哺乳动物细胞中的基因敲除功能性筛选，该遗传学工具彻底改变了研究基因功能的方式，并建立了首次报道实现的对于非编码 RNA 等基因组非编码元件的功能性敲除筛选方法学。

此外，朱诗优博士与课题组的同事研究建立了全新的 RNA 编辑方法——LEAPER 系统，首次实现不依赖任何外源蛋白表达的核酸精准高效编辑，展现出 LEAPER 在基因修复和疾病治疗领域的巨大潜力。

魏文胜教授获得2019年度北京市留学人员创新创业特别贡献奖。

“北京市留学人员创新创业特别贡献奖”是经中央批准保留，以市政府名义开展的市级表彰奖项，面向创新成果丰富或创业示范效应显著的留学归国人员。

根据生命科学学院与前沿交叉研究院的综合评审，经过学生答辩等环节，本实验室有多位学生获得了2018-2019学年度研究生奖学金和三好学生等荣誉奖励，名单如下：

向这些获奖同学表示祝贺！

经过生命科学联合中心组织的答辩和评审工作，本实验室生命科学联合中心2015级博士研究生，刘志恒同学获得了2018-2019年度校长奖学金。

根据校发《关于2018-2019学年国家奖学金评审工作安排的通知》，经过申请、班级民主素质测评、学院审核、候选人答辩等程序，本实验室璩良同学获得了生命科学学院2018-2019年度博士研究生“国家奖学金”。向璩良同学表示热烈的祝贺！

璩良同学不仅学习成绩优异，而且在科研上也不断努力与创新。在与同组同学的合作下，于2019年7月在Nature Biotechnology杂志发表了题为“Programmable RNA editing by recruiting endogenous ADAR using engineered RNAs”的研究论文，首次报道名为LEAPER的新型RNA单碱基编辑技术。

2019年9月23日，“勃林格殷格翰研究员奖及博士后基金奖颁奖仪式暨第三届北京大学-勃林格殷格翰生物医学研究联合论坛” 在北京大学隆重举行。魏文胜教授获得2019勃林格殷格翰研究员奖。

2017年，北京大学和勃林格殷格翰公司签署协议，建立战略伙伴关系合作，旨在共同推动早期科学创新，以填补肿瘤、肿瘤免疫和免疫调节、呼吸系统、心血管和代谢系统、中枢神经系统疾病等以及新兴领域的医疗需求。该战略伙伴合作关系包含多种合作形式，包括以具体科研项目为基础的共同研究、博士后奖学金及研究员奖、系列药物研发讲座等。

魏老师荣获北京大学生命科学学院2018年度未名杰出科研奖。

未名杰出科研奖基金由北京北大未名生物工程集团董事长、生命科学学院1989研究生潘爱华校友于2014年出资设立，用于表彰在科学研究中取得系列原创性成果、为生命科学学院的科研发展做出突出贡献的教师。

近日，国际著名评论型综述杂志: Nature Reviews Genetics与Nature Reviews Drug Discovery均在研究亮点（Research Highlight）专栏中对本课题组发表的题为 “Programmable RNA editing by recruiting endogenous ADAR using engineered RNAs”的论文进行了报道与评述，全文链接如下：

（1）Nature Reviews Genetics 全文链接

（2）Nature Reviews Drug Discovery 全文链接

2019年3月，魏文胜教授参加了在日本NHK电视台举行的题为“Genome Science Editing Humanity’s Future”的专题讨论，与京都大学的山中伸弥（Shinya Yamanaka）教授（诺贝尔奖获得者）、UCSF的Bruce Conklin教授以及大阪大学的加藤和人（Kazuto Kato）教授等就基因编辑发展现状、前景、挑战及伦理问题等进行了深入讨论。